Изучение кишечного микробиома и микробиома ротовой полости у пациентов, страдающих болезнью Альцгеймера

Изучение кишечного микробиома и микробиома ротовой полости у пациентов, страдающих болезнью Альцгеймера

IRN AP09259730-KC-21

 

Актуальность            

Одним из важных факторов, влияющих на здоровье человека и привлекающих все большее внимание ученых в последние два десятилетия, является микробиом человека. Микробиом человека - это сообщества микроорганизмов, обитающих на человеческом теле или внутри него. Эти сообщества имеют огромное влияние на физиологию человека как у здоровых людей так и при патологиях. Недавние исследования выявили значительные изменения микробиома кишечника и полости рта у пациентов с болезнью альцгеймера (БА) по сравнению со здоровыми пожилыми людьми. Однако, качественные изменения микробиома кишечника и полости рта у пациентов с БА из разных стран неодинаковы. Поскольку азиатское население неоднородно, биомаркеры микробиома в популяции Казахстана могут отличаться от ранее опубликованных, в том числе и у других азиатских популяций, и это важно с точки зрения разработки прогнозов и профилактических мер. Следовательно, необходимы дополнительные исследования для выявления взаимосвязи между микробиомом человека и рисками БА. 

Цель

Изучение состава и разнообразия микробиома кишечника и полости рта, выделенных у местных пациентов с диагнозом БА, по сравнению со здоровыми пожилыми людьми, для более глубокого понимания патогенетических механизмов БА и поиска новых диагностических биомаркеров и стратегий профилактики на основе анализа микробиома.

Ожидаемые результаты

  • Будут набраны пациенты с диагнозом БА и здоровые люди, соответствующие им по возрасту и полу;
  • Будет охарактеризовано бактериальное разнообразие и состав микробиома кишечника пациентов с БА;
  • Будет охарактеризовано бактериальное разнообразие и состав микробиома полости рта пациентов с БА;
  • Будет изучена взаимосвязь между кишечником человека и микробиомом полости рта и риском БА;
  • По результатам реализации проектов за весь период проекта будут получены следующие минимальные результаты:

- не менее 3 (трех) статей и (или) обзоров в рецензируемых научных изданиях, индексируемых в Science Citation Index Expanded базы Web of Science и (или) имеющих процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 35 (тридцати пяти);

- либо не менее 2 (двух) статей и (или) обзоров в рецензируемых научных изданиях, индексируемых в Science Citation Index Expanded базы Web of Science и (или) имеющих процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 35 (тридцати пяти), и не менее 1 (одного) патента, включенного в базу данных Derwent Innovations Index (Web of Science, Clarivate Analytics);

- а также не менее 1 (одной) статьи или обзора в рецензируемом зарубежном или отечественном издании, рекомендованном КОКСОН;

- либо не менее 2 (двух) статей и (или) обзоров в рецензируемых научных изданиях, входящих в 1 (первый) и (или) 2 (второй) квартили в базе Web of Science и (или) имеющих процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 65 (шестидесяти пяти);

- либо не менее 1 (одной) статьи или обзора в рецензируемом научном издании, входящем в 1 (первый) квартиль в базе Web of Science и (или) имеющем процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 80 (восьмидесяти).

- предположительно, статьи будут опубликованы в следующих журналах: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Q1, процентиль 80%) и/или Journal of Alzheimer's Disease (Q1, процентиль 91%)

- кроме того, результаты, полученные в этом проекте, будут представлены на престижных конференциях в области исследования болезни Альцгеймера и микробиома человека

Достигнутые результаты:

Спроектирован алгоритм исследования и разработаны клинические анкеты для сбора медико-демографических данных, данных для анализа питания, образа жизни и факторов риска. Был начат рекрутинг участников с диагнозом болезнь Альцгеймера в исследовательскую группу. На данный момент набрано 77 человек в группу участников с болезнью Альцгеймера. Рекрутинг контрольной группы условно здоровых лиц пожилого возраста, не страдающих когнитивными расстройствами, будет осуществлен на следующий год исполнения проекта. Анализ демографических и клинических данных показал средний возраст рекрутированных участников 67 лет в выборке г. Нур-Султан и 65 лет в г. Алматы. Более половины участников исследования являются женщинами и казахами. Около 53% участников исследования имеют повышенное артериальное давление, 30% ишемическую болезнь сердца и около 20% имеют в анамнезе сахарный диабет. Оценка когнитивных функций у участников исследования была проведена с помощью краткой шкалы оценки психического статуса, теста рисования часов и оценки неврологического статуса. Средний бал MMSE составил 14 баллов. Так же проведен опрос по социально-демографическим данным, образу жизни и питания, собраны образцы биологического материала. Экстракция бактериальной ДНК произведена из стула участников исследования, проведен количественный и качественный анализ выделенных образцов ДНК. Все выделенные образцы пополнили банк ДНК. Проведена пробоподготовка образцов с использованием набора Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq KIT и секвенирование по 16s локусу. Предварительные результаты анализа таксономическаой классификации выявила высокую индивидуальную вариабельность относительного количества микробов на уровне родов и филума.

Исследовательская группа:

ФИО

Идентификатор

Ссылки

Аскарова Шолпан Несипбаевна PhD, профессор

Scopus Author ID:  36443225300

 

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6161-1671

 

Web of Science Researcher ID: P-1091-2017

 

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=36443225300

 

 

https://orcid.org/0000-0001-6161-1671

 

 

 

https://www.webofscience.com/wos/author/record/2812301,31280432

 

Кайырлыкызы Айым, MD, MPH

Scopus Author ID:  56566707600

ORCID: 56566707600

 

Web of Science ResearcherID: F-5469-2018

 

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56566707600

 

https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0002-4911-1671

 

 

http://www.researcherid.com/rid/F-5469-2018

Олжаев Фархад Сайдикаримович, MD

Scopus Author ID:  56605070400

ORCID: 0000- 0000-0002-1906-6654

 

Web of Science ResearcherID: P-2121-2015

 

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56605070400

 

https://orcid.org/0000-0002-1906-6654

 

 

 

https://www.webofscience.com/wos/author/record/8052262

 

Цой Андрей Коншеевич, PhD в области биологических наук,

Scopus Author ID:56362596800

 

 

Web of Science Researcher ID:

K-3983-2014

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56362596800

 

 

https://publons.com/researcher/2494656/andrey-tsoy/

 

 

Публикации в рамках проекта в 2021:

Askarova, S. (2021). The Links Between the Gut Microbiome, Aging, Modern Lifestyle and Alzheimer’s Disease. Hill-Yardin. E.L. (Ed). Interactions of the Nervous System with Bacteria (pp 115-126). Lausanne: Frontires Media SA. Doi:10.2289/978-2-88966-903-5

S Askarova, A Kaiyrlykyzy, S Kozhakhmetov, D Babenko, F Olzhayev. Gut microbiome alterations in Alzheimer’s patients from Kazakhstan. 2021 Alzheimer's Association International Conference Proceedings. https://alz.confex.com/alz/2021/meetingapp.cgi/Paper/52741