Лаборатория биоинформатики и вычислительной системной биологии

Руководитель Лаборатории:Улыкбек Каиров

Научные направления:

Лаборатория биоинформатики и вычислительной системной биологии выполняет исследования по следующим направлениям:

  • Биоинформатический анализ геномных данных с высокопроизводительных платформ секвенирования нового поколения (Illumina HiSeq2000 / Illumina MiSeq / Roche 454).
  • Биоинформатический анализ и мета-анализ раковых транскриптомных профилей с высокопроизводительных микрочиповых платформ (Affymetrix/Illumina).
  • Биоинформатический анализ раковых транскриптомов и экспрессии генов с высокопроизводительной платформы секвенирования нового поколения Illumina HiSeq2000 / Illumina MiSeq.
  • Разработка новых интеграционных подходов и методов анализа полных транскриптомов и геномов человека.

Развитие биоинформатической инфраструктуры и разработка биомедицинских информационных баз на основе полученных результатов.

Описание:

Лаборатория биоинформатики и вычислительной системной биологии создана при Центре Наук о Жизни, Назарбаев Университета.

Миссией лаборатории является развитие казахстанской биоинформатики и системной биологии путем научного совершенствования кадрового состава, развития инфраструктуры, проведения исследований и коллаборации с ведущими мировыми исследовательскими центрами.

Научные исследования лаборатории направлены на изучение биологических процессов в живых организмах с применением современных биоинформатических методов и методов системной биологии.

Основные объекты научных исследований:

а) геном человека;

б) транскриптом человека;

в) геном микобактерий;

 

В настоящее время лаборатория активно коллаборирует с ведущими зарубежными научными центрами:

  • Институт Кюри, Париж, Франция (по задачам изучения онкологических заболеваний).
  • Гарвардская Медицинская Школа, США (по задачам изучения некодирующих геномных вариантов).
  • Институт Геномной Медицины, Корея (по задачам изучения генома человека).
  • НИИ ФХМ, Москва, Россия (по задачам изучения геномов и микробиомов бактерий, разработки биологических баз).

Университет Южной Калифорнии, США (по задачам изучения альтернативного сплайсинга)